Может ли окно в котельной частного дома быть меньше проектного

Если оборудование, который вы собираетесь установить в помещении вашей котельной оборудован герметичной камерой сгорния (а других в продаже сейчас не бывает), то окно не нужно вообще. Если же вы урвали по случаю какой-то другой котел, то только согласно проекта. Так говорит СНИП.

Редакция правильно разъяснила насчет газового оборудования. При строительстве своего дома хочется отступить от проекта, чтобы сделать на свой вкус. Но безопасность важнее и газовая служба должна проверять помещение котельной. Если окно не будет соответствовать проекту, придется его увеличивать. И для подключения котла нужно вызывать газовщика.